Северное викариатство образовано решением Священного Синода от 27 декабря 2011 г. (журнал № 154) в пределах Северного административного округа г. Москвы.

Распоряжением Святейшего Патриарха Кирилла от 31 декабря 2011 г. управление Северным и Северо-Западным викариатствами было поручено архиепископу Егорьевскому Марку.

Решением Священного Синода от 22 октября 2015 г. (журнал № 62) архиепископ Егорьевский Марк назначен Преосвященным Рязанским и Михайловским, главой Рязанской митрополии (4 ноября 2015 г. за Литургией в Патриаршем Успенском соборе Московского Кремля Святейшим Патриархом Кириллом возведен в сан митрополита), в ноябре 2015 г. освобожден от управления Северным и Северо-Западным викариатствами. Управляющим Северным и Северо-Западным викариатствами назначен епископ Бронницкий Парамон.

Решением Священного Синода от 26 февраля 2019 г. (журнал № 9) епископ Бронницкий Парамон назначен наместником Свято-Троицкой Сергиевой лавры с титулом «Сергиево-Посадский». Распоряжением Святейшего Патриарха Кирилла от 28 февраля 2019 г. епископ Сергиево-Посадский Парамон освобожден от управления Северным и Северо-Западным викариатствами. Тем же распоряжением Его Святейшества управляющим Северным и Северо-Западным викариатствами назначен епископ Бронницкий Фома. 12 марта 2019 г. епископ Бронницкий Фома освобожден от управления Северным викариатством. Распоряжением Святейшего Патриарха от 12 марта 2019 г. управляющим Северным викариатством назначен епископ Сергиево-Посадский Парамон.

Решением Священного Синода от 25 августа 2020 г. (журнал № 51) епископ Сергиево-Посадский Парамон освобожден от должности наместника Свято-Троицкой Сергиевой лавры с сохранением обязанностей викария Святейшего Патриарха Московского и всея Руси с титулом «Наро-Фоминский». Распоряжением Святейшего Патриарха Кирилла от 3 сентября 2020 г. епископ Наро-Фоминский Парамон назначен управляющим Северо-Западным викариатством, с сохранением управления Северным викариатством.

Распоряжением Святейшего Патриарха Кирилла от 29 августа 2023 г. епископ Наро-Фоминский Парамон освобожден от управления Северным и Северо-Западным викариатствами г. Москвы. Распоряжением Святейшего Патриарха Кирилла от 30 августа 2023 г. архиепископ Егорьевский Матфей в дополнение к несомым послушаниям назначен управляющим Северным викариатством г. Москвы.